石英玻璃化学成分是二氧化硅，有人曾经说“什么是水晶？ 水晶就是玻璃。”从研究方面来说水晶就是玻璃”的说法显然是不对的。略有宝石知识的人都知道，水晶是一种天然的透明的石英矿物晶体;而玻璃呢，则是一种人工制造的非晶质体。即使是石英玻璃和水晶二者化学成分都是二氧化硅，又都是透明体，然而从二者的内部结构看却有着本质上不同。
水晶是稀有矿物，宝石的一种，石英结晶体，在矿物学上属于石英族。主要化学成份是二氧化硅，化学式为SiO2。而玻璃是非晶无机非金属材料，它的主要成分为二氧化硅和其他氧化物。普通玻璃的化学组成是Na2SiO3、CaSiO3、SiO2或Na2O·CaO·6SiO2。从上看出二者化学成分截然不同。
近代应用X射线分析的方法，具体揭示了大量晶体的内部结构。现已证明，一切晶体不论其外形如何，它的内部质点（原子、离子和分子）都是作规律排列的，这种规律主要表现为质点的周期重复，从而构成了所谓格子状构造。因此，按照现代的概念，物质中凡是质点做规律排列，即具有格子构造者称为结晶质。结晶质在空间的有限部分即为晶体。由此，我们可以对晶体下定义为：晶体是具有格子构造的固体。
由此可见，水晶与玻璃是两种不同的物质，认为水晶是玻璃是没有科学依据的。
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